За допомогою мантр очищають внутрішній простір для того, щоб до нього увійшов Бог.
Мантри також можуть зцілювати, впливати на роботу внутрішніх органів, очищати енергетичні канали, активізувати чакри, перетворювати внутрішню енергію, викликати потрібні емоції, заспокоювати або концентрувати розум, очищати свідомість і занурювати його в стан медитації. Біджа-мантри (насіння-мантри) - це неперевідні однослогові мантри, кожна з яких є звуковим втіленням енергії певного типу. Кожна біджа-мантра відповідає будь-якій дії (розширення, стиснення тощо), точці організму, елементу або будь-якому аспекту Бога. Наприклад біджа-мантра «лам» пов'язана з елементом землі і чакрою муладхарою, «вам» - з елементом води і весільною, «рам» - з елементом вогню і маніпурою, «йам» - з елементом повітря і анахатою, «хам» - з елементом простору і вишуддхою.
Однією з практик тантри є відчуття будь-якого звуку як мантри. Усі літери санскритського алфавіту є біджа-мантрами. Назва предмета або явлення на санскриті (і деяких інших стародавніх мовах) така, що поєднання біджа-мантр, з яких складається відповідне слово, виражає саме ту енергію, яка міститься в даному предметі або явищі. Тому в тантрі вважається дуже важливим говорити істину: якщо слова не відповідають дійсності, то також і пробуджувана ними енергія не відповідає енергії реальності. Енергія, народженою брехнею, не знаходить собі місця в реальному світі і врешті-решт звертається проти того, хто її вимовив. Навпаки, якщо реалізований майстер або святий говорить те, чого немає, то його слова матеріалізуються: енергія, яку він пробуджує словами, настільки сильна, що змінює реальність. У тантрі вважають, що сутність людини полягає в її промові, і оскільки звук тісно пов'язаний з енергією, то під словом «мова» розуміють не тільки «звичайну» мову, але всю внутрішню енергію людини, і навіть часто замінюють термін «енергія» на «мову».
Багато мантрів мають комплексний вплив, впливаючи відразу на три сфери існування людини: тіло, енергію і свідомість. Наприклад таку властивість має одна з головних мантр шайвів «Ом намаа Шивайя». Перевести її можна так: "Ом. Славлю ім «я Господа (Шиви)». Її внутрішній і таємний смисли такі. «Ом» є злитною вимовою біджа-мантри «аум». У тантрі є уявлення про те, що все Творіння породжено мантрою «аум», яка є біджа-мантрою Всесвіту. В «аум» звук «а» відноситься до виявленого світу, фізичного Всесвіту. Звук «у» пов'язаний зі світом енергії. Звук «м» уособлює Вищу Свідомість. Для людини ж звук «а» пов'язаний з його тілом і звичайним станом свідомості. Звук «у» пов'язаний з внутрішньою енергією людини і свідомістю в стані сновидіння або мрій. Звук «м» пов'язаний зі свідомістю в стані сну без сновидінь («Мандукья упанишад»). «Намаа» символізує напрямок куди-небудь або з'єднання з чим-небудь. «Шивайя» уособлює океан Вищої Божественної Свідомості. Таким чином, виголошення «Ом намаа Шивайя» означає: «Я весь - тілом, енергією і всіма станами свідомості - з'єднуюся з Богом». (Цікаво, що слово «Аллах» для суфіїв має точно таке ж значення. Так, звук «а» - буква «аліф» - символізує людину. Подвійне «лл» - дві літери «лям» - прагнення до чого-небудь, преклоніння перед ним. «Ах» символізує перехід до Позамежного... Дійсно, «Істину можна уподібнити фонтану, який б'є вгору одним струменем, а вниз падає багатьма краплями в різний час і на різні місця» (Інайят Хан).
Мантри повторюють не тільки в слух (джапа), а й про себе (аджапа джапа). Також їх повторюють, концентруючись у будь-якій чакрі і домагаючись відчуття того, що мантра звучить всередині чакри. Є практики, при яких мантрою насичують кожну клітку тіла, так, щоб весь організм перетворився на вібруючу мантру. Часто повторення мантр поєднують з дихальними вправами. Наприклад, у мантрі «з хам», що означає «я є То (тобто Бог)» на вдиху вимовляють «со», а на видиху - «хам».
Також у практиці тантри використовуються бурштини, які тісно пов'язані з мантрами. Бурштин (дослівно - машина, що працює) - це малюнок у вигляді діаграми, який, подібно до мантри, має силу впливати на стан тіла, енергії та свідомості. Мантра є звуковим втіленням енергії, а бурштин - її зоровим втіленням. Подібно як звуки музики можуть бути записані нотами, так само і мантра може бути зображена відповідною бурштиною. Складні бурштини називають мандалами. Бурштини малюються на шовку, корі певних дерев, міді, золоті або тілі; процес створення бурштину сам по собі є особливим ритуалом. Для медитації бурштину споглядають так, щоб вона «затягнула» свідомість у себе. Найчастіше, щоб посилити ефект, бурштину споглядають, промовляючи відповідну їй мантру; зображення багатьох бурштинів містять вписану мантру. Бурштини не тільки споглядають, їх також візуалізують всередині свого тіла. Деякі бурштини мають великі розміри і намальовані на землі. Такі бурштини використовують для проведення всередині них спеціальних пудж (ритуалів поклоніння); при цьому бурштин працює як устрій, що виявляє Божественну енергію. Дхуні (яма для ритуального розпалювання священного вогню) також є бурштином. У тантрі всі предмети і явища розглядають як своєрідні бурштини; навіть весь Всесвіт - це нескінченна космічна бурштину. Найкращою бурштиною вважається тіло людини. Так, асани (пози) хатха-йоги - це не що інше, як бурштини, сформовані з тіла. Кожна така «тілесна бурштину» створює властиву тільки їй енергію, яка і «працює» в даній асані. Особливу роль має практика, за якої індивідуальна свідомість сприймається як бурштин, що дозволяє вийти за його власні межі.